La Commission scolaire est administrée par un Conseil des commissaires composé de 21 personnes - une par circonscription -, élues au suffrage universel, et de deux commissaires-parents, nommés par les commissaires. Le Conseil exerce tous les pouvoirs et fonctions de la Commission scolaire. Les élections scolaires ont lieu à tous les quatre ans.

Le Comité exécutif, dont le mandat est l’exécution des mandats délégués par le Conseil des commissaires, est nommé par ce dernier. Il est formé de neuf personnes, dont cinq commissaires, deux représentants des parents, du directeur général et du secrétaire général.

Le Conseil des commissaires élabore les grandes orientations, objectifs et valeurs de la Commission scolaire et voit à leur application. Il adopte aussi les politiques administratives et pédagogiques ainsi que les modes de fonctionnement et s’assure du respect des lois et des règlements.